随着信息化和智能化的应用，南京海关也将其利用到了口岸。在物流环节，推进了“互联网+物流”建设，完善“掌上物流”系统功能，实施车辆放行凭证电子化，提升口岸物流运行效率。近日，无锡海关首票快件货物已经通过“掌上物流”系统实现卡口智能验放试点成功，车辆驾驶员通过手机APP提前申报完毕后，在通过无锡机场快件监管中心卡口时，系统通过识别车牌号，自动抬杆验放快件，成功实现了快件运单数据与进出场所车辆物流数据的自动对比。
在“掌上物流”基础上，南京海关还开发了“慧眼通”信息化系统，通过综合运用卫星定位、地理信息系统、智能视频分析、时间分析、卡口自动识别等多项物联网和移动互联网技术，对进行分析，形成“虚拟封闭管理”。该项目在南通综合保税区上线运行后，区内大量的非报关货物可直通验放，通关时间从5分钟缩短至5秒钟，效率提升98%。
