学校于1993年由厦门市原政协主席蔡望怀等知名人士集社会力量捐资创办。创办伊始，学校董事会就坚持“零回报”办学模式，董事会成员不取分文酬劳;坚持公益性和非营利性定位，学校法人资产不转移、不分割、不流失，并且建立了风险保障基金，属完全公益性的教育机构。
学校根据福建省和厦门市规划，以区域支柱产业和战略性新兴产业为导向，以工学为主、管理学为辅的学科专业发展原则，初步形成了“民生科技类”、“信息技术类”、“现代服务类”三个学科专业群。
学校以科研创新平台为依托，加大力度引进和培养学科专业建设带头人和中青年优秀人才，不断优化年龄结构、学缘结构、职称结构，一批年富力强、具有高学历、高职称或海外留学背景的教师担当学术领军人物和教学、管理骨干，形成了合理的学术梯队和专业教学团队，进一步提升了应用技术型人才培养的能力。
展望未来，华厦学院坚持非营利性办学宗旨，坚定地走应用技术大学办学之路，脚踏实地、求新务实、打造特色、树立品牌，朝着建设全国一流应用技术大学的办学目标不断前进。
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